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定期清潔
1.應使用中性肥皂溶液清洗基座上面的孔穴。(避免使用強堿、濃酒精和有機溶劑溶液)
2.應保持本機下面及其左，右散熱窗無其它物品，機器在使用一段時間后散熱窗上將粘附一些灰塵，應及時清理，這是很重要的。
3.基座應經常清理，基座孔穴內一旦存積一些反應物殘渣，將影響溫度響應，建議用棉布定期擦洗。
故障檢查
反應結果不佳
在本機上進行反應，而最終沒有得到所期望結果時，問題可能在生物學方面、程序或電源上，為了幫助區別電源故障，本機安裝有用于自檢的硬件和用以自診的軟件，下面將有詳細的敘述，根據我們的經驗，通常大部分問題是生物學和程序方面的事，常見故障如下：
1.反應物品不對，或數量不夠，或純度差或微量的單核鏈區不正確。
2.變性溫度太高或過低，在本機上，推薦使用90一92℃，維持40秒，根據反應量的多少可相應增減時間。
3.“退火”溫度太高或太低，應在55-70℃， 20到30個鏈為宜。
4.反應物濃度太高或太低。
5.準備過程未經特殊處理。應在70℃ 的礦物油中處理。
6.程序中的時間和溫度值不合適。
7.樣品或樣品電極溫度稍低，而基座溫度稍高。
8.檢查反應管是否安放好，可用一點兒礦物油涂覆小孔，以便增加熱傳導。
本機自檢和自診功能
開機操作時，本機會運行自檢程序，檢測儀器軟件和硬件并顯示結果。以便盡早通知用戶潛在的問題，盡可能減少實驗失敗。并在發生故障時顯示錯誤信息
注意事項
1.電源
A.本機對電源無特殊要求，運用范圍寬，交流100V-240V，但電源電壓波動能太大，以免損壞機內器件，否則應考慮加裝穩壓電源。
B.本機在運行程序過程中，禁止用切斷電源的方法結束實驗，原因有二：
其一、對執行程序不利;
其二、電源切斷后，風機停轉，元件散熱不暢，易積熱損壞。
2.此儀器為大功率加熱制冷電子儀器：一定要保證實驗儀器的通風散熱良好，盡量保證在儀器運行一段較長時間后停用一會(如使用半天停用一個小時左右)，以保證其內部元器件的散熱及工作性能完好
3.清洗注意事項
當清洗本機基座時，應避免液體進入機器內部，做實驗過程中，也許加有放射性物質，在清洗時應格外當心。本機不宜在潮濕、曝曬的環境中使用。
4.注意儀器的清潔，尤其注意風口、BLOCK加熱模塊的清潔，具體維護參照PCR儀日常維護及注意事項卡片。
