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過氧乙酸是一種殺菌能力較強的高效消毒劑，它可以迅速殺滅各種微生物，包括病毒、細菌、真菌及芽孢。由于它腐蝕性極強，必須按比例稀釋后使用，否則會造成灼傷。它也不能用于人體皮膚消毒。
一、對地面、墻壁、門窗消毒
將濃度為0.2%～0.5%的過氧乙酸溶液裝入噴霧器中噴霧消毒。泥土墻吸液量為50毫升/平方米～300毫升/平方米，水泥墻、木板墻、石灰墻為100毫升/平方米。對上述各種墻壁的噴灑消毒劑溶液不宜超過其吸液量。地面消毒先由外向內噴霧一次，噴藥量為200毫升/平方米～300毫升/平方米，待室內消毒完畢后，再由內向外重復噴霧一次。以上消毒處理，作用時間應不少于60分鐘，然后打開門窗通風。
二、對房屋空間消毒
房屋經密閉后，用濃度為15%，用量為每立方米空間7毫升的過氧乙酸溶液(1克/立方米)，放入瓷或玻璃器皿(可以用于加熱的)中，用酒精爐或燃氣爐加熱蒸發，薰蒸120分鐘，即可打開門窗通風?；蛴脻舛葹?%的過氧乙酸溶液(8毫升/立方米)噴霧消毒，保持時間應當為30分鐘～60分鐘，然后打開門窗通風。
三、對衣服、被褥消毒
將欲消毒的衣物懸掛在室內(切勿堆集成一堆)，密閉門窗，糊好縫隙，用濃度為15%，用量為每立方米空間7毫升的過氧乙酸溶液(1克/立方米)，放入瓷或玻璃容器(可以用于加熱的)中，用酒精爐或燃氣爐加熱蒸發，薰蒸60分鐘～120分鐘后，即可打開門窗通風。
四、對餐(飲)具消毒
用濃度為0.5%的過氧乙酸溶液將餐(飲)具浸泡30分鐘，浸泡時，消毒液要漫過被消毒的器具，最后再用流動的清水將餐(飲)具洗凈。
五、對食物消毒
瓜果、蔬菜類食物用濃度為0.2%～0.5%的過氧乙酸溶液浸泡10分鐘，浸泡時，消毒液要漫過食物，最后再用流動的清水將食物洗凈。
六、對盛排泄物或嘔吐物的容器消毒
用濃度為0.5%的過氧乙酸溶液浸泡30分鐘，浸泡時，消毒液要漫過被消毒容器，然后再用流動的清水洗凈。
七、對家用物品、家具消毒
用濃度為0.2%～0.5%的過氧乙酸溶液進行浸泡、噴灑或擦洗消毒，對于浸泡或噴灑消毒后的物品，應當用流動的清水洗干凈或用潔凈的抹布擦干凈。
八、對手與皮膚消毒
如果手或皮膚污染嚴重時，可用濃度為0.2%的過氧乙酸溶液浸泡，或用濃度為0.2%的過氧乙酸棉球、紗布塊擦拭，然后再用流動的清水洗凈。
九、對運輸工具消毒
車、船內外表面和廂艙空間，可用濃度為0.5%的過氧乙酸溶液噴灑至表面濕潤，保持時間不少于60分鐘。對車船廂艙進行消毒時，應先將空間密封，將濃度為15%，用量為每立方米7毫升的過氧乙酸溶液(1克/立方米)，放入瓷或玻璃器皿(可以用于加熱的)中，用酒精爐或燃氣爐加熱蒸發，薰蒸消毒120分鐘。
使用注意事項
a、過氧乙酸消毒液應嚴格按照所購入的過氧乙酸消毒液的濃度和使用說明進行調制，一旦有過氧乙酸消毒液濺到皮膚上或眼睛里，應當立即用流動的清水沖洗，以免造成燒傷。
b、防止腐蝕和損傷：使用過氧乙酸時應防止損壞物品，不得用于精密儀器和鋒利的器械消毒，擦拭消毒后立即用水擦洗干凈。因其具有漂白作用，鮮艷的花色紡織品亦不可用過氧乙酸浸泡。生產操作者要采取防護措施，如防護眼鏡、防護手套、防護鞋等，以防止沾染到皮膚上造成損傷。
c、不可用于地面消毒：過氧乙酸對大理石和水磨石等材料地面有明顯損壞作用，切忌用其水溶液擦拭地面。
d、確保使用濃度：過氧乙酸不穩定，配制時要保證濃度，隨時使用隨時配制，防止過期使用。應嚴格按照所購入的過氧乙酸消毒液的濃度和使用說明進行調制，在不知確切濃度的情況下，使用前應用消定法或專用試紙測試濃度。不能過高，也不能過低。
